Στο "Dark Phoenix", οι X-Men αντιμετωπίζουν τον πιο τρομερό και ισχυρό εχθρό τους, τη δικιά τους Jean Gray. Παραδομένη στη Δύναμη του Φοίνικα η Jean Grey είναι μια βόμβα έτοιμη να εκραγεί ανά πάσα στιγμή και οι δικοί της οφείλουν να αποφασίσουν ποιον θα προδώσουν και γιατί. Αξίζει η ζωή της περισσότερο από την ύπαρξη ολόκληρου του σύμπαντος..;
Η ιστορία είναι βασισμένη στη σειρά comics Phoenix του Chris Claremont και εξελίσσεται 10 χρόνια μετά τα γεγονότα του "X-Men: Apocalypse"