Βρισκόμαστε στο 2267 μ.Χ., πέντε χρόνια μετά τα γεγονότα του Babylon 5, και αμέσως μετά την ταινία A Call to Arms. Οι Drakh έχουν εξαπλώσει μια μάστιγα "νάνο-ιών" στη Γη, που θα καταστρέψει όλη τη ζωή στη Γη μέσα σε πέντε χρόνια, εάν δεν την σταματήσει κάποιος. Για το σκοπό αυτό, στέλνεται η ειδική ομάδα Excalibur για να ψάξουν για κάτι που θα μπορούσε να βοηθήσει την αναζήτηση για την καταπολέμηση του ιού.